1、通過重復性rTMS和不同頻率的刺激，對大腦神經(jīng)元和相關功能進行改善。這種通過改善電位對神經(jīng)元進行調(diào)整的效果，是傳統(tǒng)的電刺激和其它物理方法無法實現(xiàn)的。

　　2、TMS引起皮質(zhì)較廣泛的c-fos基因表達増加，近中線結(jié)構(gòu)(紋狀體、丘腦、扣帶回、室旁核等)優(yōu)為顯著，在果松體、視網(wǎng)膜及調(diào)節(jié)生物節(jié)律區(qū)，有更敏感的轉(zhuǎn)錄因子CREB磷酸化形式表達增加。TMS引起的這種效應更明顯。

　　3、MS可以通過不同的參數(shù)刺激，改變不同腦區(qū)的血流、代謝、興奮性及內(nèi)分泌功能發(fā)揮治療作用。

　　4、高頻率、高強度rTMS可產(chǎn)生興奮性突觸后電位總和，導致刺激區(qū)神經(jīng)異常興奮。低頻刺激則相反，低頻可抑制神經(jīng)興奮，通過雙向調(diào)節(jié)大腦興奮與抑制功能之間的平衡來治療疾病。